Проектът "Рехабилитация на железопътната инфраструктура в участъци от железопътната линия Пловдив - Бургас" представлява първа фаза на проекта и се състои от 3 позиции. Втората фаза остава за втория програмен период 2014 - 2020 г.
Позиция 1: "Рехабилитация на железопътната отсечка Mихайлово – Калояновец", 21 км, вече е завършена и на 15 април 2014 г. е въведена в експлоатация.

Позиция 2: "Рехабилитация на железопътните отсечки Стара Загора – Завой– Зимница", 120 км, е към края си. Физическото изпълнение на договора е 83.78%.

Позиция 3: "Рехабилитация на железопътната отсечка Церковски – Карнобат – Бургас", 150 км, получи право на по-късно приключване. На 9 декември 2013 г. е подписано допълнително договорно споразумение №2 към договора, с което е удължено времето за завършване до 6 ноември 2014 г. Физическото изпълнение на обекта е 71.65%.

В проекта попадат и обекти за рехабилитация на тягови подстанции, оценка на съответствието и строителен надзор за петте тягови подстанции, както и проектиране и изграждане на системи за сигнализация и телекомуникации в жп възел Бургас. Предвидени са четири обществени поръчки. За двете тягови подстанции търгът е проведен, комисията е приключила работата си. За тяговите подстанции Бургас, Карнобат и Ямбол търгът е обявен. Строителният надзор за петте тягови подстанции вече е избран - това е  ЕТ "Ел транс инженеринг-ВМ".
Очакваното изпълнение на проекта е юли 2015 г.