Основните предизвикателства при реализирането на жп проекта Видин – София са съгласувателните процедури с външни институции, отчуждителните процедури и финансирането на строителството на обекта.
Това стана ясно по време на представянето на "Проектиране на строителството на железопътната линия Видин - София: актуализация на проекта и подготовка на железопътен участък Видин-Медковец".
Проектът се осъществява със съфинансиране от Европейския фонд за регионално развитие чрез Оперативна програма "Транспорт" 2007-2013 г. и  беше представен от Мария Чакърова, директор на дирекция "Стратегическо развитие и инвестиционни проекти" в ДП НКЖИ, ръководителя на проекта в НКЖИ Михаил Ангелов и от представителите на изпълнителите на двете части от трасето: Валентин Михайловски за Видин – Медковец и Маргарит Жипонов за Медковец - Столник.

Стойността на актуализирания проект Видин – Медковец от 540 млн. евро е сведена до 405 млн. евро. Надеждите на НКЖИ са той да получи финансиране по Механизма за свързване на Европа по поканата от ноември 2015 г. Участъкът е с дължина 65 км. По трасето има 33 моста и 2 тунела, единият от които е с дължина 1985 м, а вторият – 300 м, линията е единична, теренът, през който преминава, е планински и по тази причина по него има големи съоръжения. Най-дългият от мостовете е 1050 - 1070 м, по-дълъг е и от Дунав мост 2 и е висок 110 м.

Участъкът Медковец – Руска бяла – Столник е разделен на две части с обща дължина близо 148 км. Участък 3 е жп линията Столник – Руска бяла, предвидено е да бъде двойна поради близостта си до София. Дължината на участъка е 68.432 км. Изключение прави частта край гара Осоица, където жп линията е единична и там преминава в еднопътен базов тунел с дължина 12.5 км. Участък 2 е жп линията Руска бяла – гара Медковец – също е единична линия с дължина 79.4 км. В двата участъка има 48 жп моста и 11 пътни надлеза, в тази част от трасето се намира и най-дългият тунел  - 12.5 км.